NGS实验室装修、设计建设

NGS实验室又叫高通量测序检测实验室。NGS是下一代测序技术( Next Generation Sequencing)即高通量测序技术的简称。高通量测序技术是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变, 可同时对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,也称为深度测序(Deep sequencing)。

                                                                       NGS实验室设计
一、实验室空间设计
NGS实验室需要设有准备样本、提取DNA/RNA、建库、测序等多个区域,这些区域需要根据工作流程合理布局,确保不同步骤之间不会相互干扰。另外,实验室应根据实验人员数量和设备配置合理设计大小,确保实验室的通风和安全性。
1、试剂准备室主要功能:在NGS过程中使用到的试剂的配制、分装和保存。
2、标本与文库制备区主要功能:血液处理、血浆制备、DNA提取、DNA片段化、DNA样品的纯化、DNA浓度检测、末端修复、接头连接、构建样本的测序文库。
3、文库扩增与检测区主要功能:文库构建后的PCR扩增与纯化、文库浓度检测、文库的混合及混合后的质检分析。
4、测序区主要功能:测序模板制备(乳液PCR与磁珠富集回收)、上机测序、数据分析、报告审核及发放。

                                                                        NGS实验室装修
二、设备配置和使用
NGS实验室需要配备测序仪器、建库仪器、PCR仪器、冷冻保存设备等多种设备,这些设备应该根据实验工作流程的需要合理配置,并且设备之间应该有足够的间距以便于维护和操作。
1、试剂准备室
主要仪器设备:加样器、冰箱、分析天平、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、可移动紫外灯和超净工作台等。
2、标本与文库制备区
主要仪器设备:冷冻离心机、微量台式离心机、掌上三管离心机、涡旋震荡器、垂直混合仪、移液器、可移动紫外灯、生物安全柜、冰箱、托盘天平、Qubit 2.0核酸定量仪、电脑(可连接互联网)、条形码打印机、普通打印机、扫描枪、磁力架等。
3、文库扩增与检测区
主要仪器设备:PCR仪、QPCR仪、Qubit2.0核酸定量仪、可移动紫外灯、超净工作台、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器、UPS、冰箱、移液器、磁力架等。
4、测序区
主要仪器设备:高通量测序仪、PC电脑、打印机、UPS、恒温金属浴、纯水仪、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、超净工作台、可移动紫外灯、磁力架、PCR仪等。

                                                                         NGS实验室建设
三、安全性
NGS实验室应该遵守生物安全法规,配备相应的生物安全柜、紫外线消毒设备、生物废弃物收集设施等,确保实验过程中的生物风险得到控制。
四、通风与空调
NGS实验室需要考虑通风和空调系统的设计,以确保实验室内的温度、湿度、洁净度等参数符合要求。同时,实验室通风系统应该能够控制实验室内的有害气体和粉尘,避免污染实验样本。

   

分区

压力

温度

相对湿度

照明

专用走廊

0Pa

20-25℃

40%~60%

主实验室≥300LX,其余房间200~300LX

缓冲区

+5Pa

试剂准备室

+15Pa

标本与文库制备区

+10Pa

文库扩增与检测区

-5Pa

测序区

-10Pa

 五、废弃物处理
NGS实验室需要设立生物废弃物处理区,将实验过程中产生的生物废弃物进行规范的收集、储存和处理。

 

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